La théorie qui sous-tend les élixirs veut que les fleurs, tout comme les émotions, soient porteuses de vibrations qu'on ne peut ni toucher, ni voir, mais ressentir et qui ont le pouvoir d'agir sur le système énergétique. Elles permettent d'intervenir sur les déséquilibres émotifs, sur le caractère, la personnalité, le tempérament, ou les attitudes des personnes. Les élixirs aident à équilibrer les différents plans (physique, émotif, mental et spirituel), à mieux gérer les sautes d'humeur et les idées noires, et à acquérir certaines qualités.
Pour se soigner à l'aide d'élixirs floraux, on doit d'abord repérer ses traits de caractère nuisibles. On choisit ensuite les essences qui correspondent à notre cas. Ce processus, relativement simple, exige de prendre du recul par rapport à soi-même, ce qui n'est pas toujours facile. De plus, pour un même symptôme, plusieurs fleurs peuvent être indiquées. Il s'agit alors de découvrir la cause profonde du problème. Qu'est-ce qui se cache derrière une dépression, par exemple? Cela peut être un deuil mal vécu, un congédiement, un manque d'intérêt...
Si l'on ne parvient pas à y voir clair, on peut consulter un praticien spécialisé en élixirs. Pendant l'entretien, le conseiller analyse le comportement de la personne. Il observe son expression, son attitude et les mots qu'elle emploie pour décrire sa situation. Ce « remue-méninges » permet d'identifier les sentiments présents ainsi que certains traits de la personnalité. C'est à partir de ces éléments que l'intervenant proposera un élixir ou un mélange d'élixirs adapté à la personnalité et à l'état de son client.